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参考文件管理系统是指一种用于组织、分类和存储大量参考文件的系统。这些参考文件可以是学术论文、文献综述、研究报告、白皮书、技术规范、行业报告等。参考文件管理系统可以帮助个人或团队轻松管理自己的参考文件，同时提供可靠的文献资源库以供参考和引用。在管理参考文件的同时，参考文件管理系统还具备一定的搜索功能，可以快速找到所需文献资料。常见的参考文件管理系统包括EndNote、Zotero和Mendeley等。
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